全基因随机突变 vs 聚焦饱和突变
epPCR 与 Saturation Mutagenesis 的策略差异与适用场景

全基因随机突变 · epPCR

无需结构信息:当没有 X 射线结构或同源模型时的首选方法。

机制:通过调整 PCR 循环数与 Mg²⁺/Mn²⁺ 浓度,在全基因范围内随机引入点突变。

氨基酸偏好性:碱基转换/颠换概率不均等,导致氨基酸替换存在 bias。

累积冗余:多轮 epPCR 会累积大量对功能无贡献的"旁观者"突变,增加筛选负担,甚至损害稳定性。

适用:盲筛、探索全新功能、无结构数据时的起点。

聚焦饱和突变 · Saturation Mutagenesis

依赖结构信息:需要 X 射线结构或同源模型来决策随机化位点。

机制:在预定位置(单个或多个残基)引入全部 19 种其它氨基酸,构建聚焦库

库容量小且聚焦:单点饱和仅 ~20 个变体,多位点组合也远小于 epPCR 全库。

协同效应:同一位点的多点突变可产生非加和性(non-additivity)的协同效果。

典型方案:QuikChange® 协议,使用携带突变信息的互补引物。

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