定向进化策略全景图
从基因突变、重组到计算辅助及策略选择的核心路径
定向进化策略全景思维导图 以定向进化为中心,展示随机突变、重组、计算辅助和策略选择四大分支及其核心方法。 定向进化策略全景 定向进化 Directed Evolution ① 随机突变 epPCR · 饱和突变 ISM · CAST · B-FIT ② 基因重组 DNA shuffling Family · ADO ③ 计算辅助 SCHEMA · ProSAR HotSpotWizard ④ 策略选择 Lateral hits · 多参数 NNK vs NDT · 质控 从随机探索到理性设计:库容量、筛选通量与计算指导的平衡
随机突变路径 — epPCR 适合无结构信息时的全基因随机突变;饱和突变聚焦特定位点;ISM 通过迭代方式系统探索序列空间,CAST 针对活性位点、B-FIT 针对热稳定性。
重组路径 — DNA shuffling 要求 ≥70% 同源性;Family shuffling 利用同源家族基因;ADO 通过人工合成寡核苷酸突破同源性限制。
计算辅助SCHEMA 用接触矩阵最小化重组破坏;ProSAR 统计序列-活性关系;HotSpotWizard 整合多维信息识别改造热点。
策略核心 — 保留 lateral hits 避免局部最优;NNK/NDT 密码子策略降低筛选压力;文库质控防止"寻找不存在的东西"。
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